Навіть якщо ви мешкаєте в районі з артезіанськими джерелами, при сумнівах, якою водою заправляти іригатор, віддайте перевагу дистильованій, кип'яченій або просто очищеній через фільтр воді. Слабоконцентровані водні розчини солі чи соди – ще один варіант, чим можна заправляти іригатор.
У іригатор можна заливати тільки воду та спеціальні бальзами для іригатора. Ополіскувачі для порожнини рота сильно піняться всередині резервуару, а трав'яні настої дають осад. Все це може швидко вивести пристрій з ладу.
Для чищення необхідно використовувати кип'ячену відфільтровану воду. Ідеальною для процедури може вважатися дистильована вода, але це досить затратний варіант.