Основні показання до застосування – виразки та ерозії на шкірі, рани, що в'яло заживають, тріщини заднього проходу та молочних залоз, термічні, хімічні та променеві опіки, переломи кісток, фотодерматит, бульозний дерматит. Його використовують для профілактики після опромінення новоутворень на шкірі та геніталіях.
Метилурацилова мазь пом'якшує шкіру та призводить до її здорового вигляду. Основне завдання – посилення регенерації пошкоджених тканин. Завдяки активізації клітинного обміну вона сприяє швидкому загоєнню. Багато жінок використовують метилурацил замість крему, що омолоджує.
Метилурацил доцільно призначати при легких формах лейкопенії. При захворюванні середнього ступеня тяжкості препарат приймають лише після відновлення порушень регенерації клітин крові. При тяжких формах ураження кровотворення метилурацил не призначають.